Is een bacterie de oorzaak? Dan krijg je antibiotica. Meestal moet je het antibioticum dan toevoegen aan de spoelvloeistof. Zo komt het middel rechtstreeks in de buikholte. Soms schrijft de arts pillen voor. Antibiotica werken bijna altijd. Je hoeft dan niet in het ziekenhuis te blijven (of alleen heel kort).
Heel af en toe werken antibiotica niet goed bij een buikvliesontsteking. Je wordt dan opgenomen in het ziekenhuis. Het kan zelfs gebeuren dat de katheter eruit moet. Mogelijk krijg je later een nieuwe katheter, maar tot die tijd stap je tijdelijk over op hemodialyse.
Tijdens een buikvliesontsteking is de filterwerking van het buikvlies minder goed. Meestal is dit tijdelijk. Bij ernstige buikvliesontsteking kan het buikvlies wel beschadigd raken. Dan is peritoneale dialyse soms niet meer mogelijk.