Sommige medicijnen gaan niet goed samen met hemodialyse. Ze verdwijnen bijvoorbeeld te snel uit het bloed door de dialyse. Of de dialyse versterkt het effect van de medicijnen te veel.
Een voorbeeld: tijdens de dialyse gaat je bloeddruk omlaag. Als je dan ook nog een bloeddrukverlagend medicijn inneemt, kun je duizelig worden. Daarom mag je geen medicijnen tegen hoge bloeddruk gebruiken op dialysedagen. Ook voor sommige andere medicijnen geldt dat je ze niet op dialysedagen mag gebruiken, of alleen op een aangepaste manier.
Andere medicijnen krijg je juist op de dialysedagen. Bijvoorbeeld middelen die je een keer per week of maand gebruikt. Dat zijn onder meer EPO, ijzer en alfacalcidol. Op niet-dialysedagen worden resten van de medicijnen niet goed uit het bloed gefilterd. Het risico op bijwerkingen neemt dan toe. De dialyse zorgt ervoor dat de resten van de medicijnen uit het bloed verdwijnen.